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수산생물에 발생하는 각종 질병의 진단과 치료 및 예방에 대하여 연구하고 교육하며, 수산생물의 체계적인 질병관리, 친환경수산물 생산관리 및 첨단과학 분야에 종사할 수 있는 전문 인력을 양성하는데 교육목표를 두고, 다양한 전공분야의 실험실습 및 현장실습이 강화된 교과과정으로 운영되고 있다.
수산생물질병을 전문적으로 담당할 수 있는 전문인력을 양성하고 과학적인 치료 기틀을 마련하기 위하여 정부에서는 수산질병관리사 국가면허 제도를 2004년부터 시행해 오고 있으며 이 면허를 취득하면 수산생물질병 전문가로서 수산질병관리원을 개원하여 수산생물질병의 진단, 치료 및 예방 업무를 할 수 있다. 나아가 심도있는 공부를 위해 대학원을 진학하거나, 국립수산과학원, 농림축산검역본부, 식품의약품안전처, 국립환경과학원, 질병관리본부, 한국수산과학기술진흥원 등의 국가직 공무원, 각 지자체의 해양수산연구소의 지방직공무원, 한국수력원자력연구소, 대기업체 아쿠아리움, 해양수산박물관, 한국농어촌공사, 수산용의약품제조회사, 사료회사, 수산물 유통·가공업체 및 양식업체 등 다양한 분야로 진출할 수 있으며, 수산해양관련 잡지사나 신문사 기자로도 활동할 수 있다.